转录组测序流程步骤是哪些?

?张张sea i see 2024-05-27 02:45:37
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以真核转录组测序为例,实验流程为总rna提取-mrna分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-ssr分析及snp分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使rna、核糖体rna、转运rna及非编码rna;狭义上指所有mrna的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,转录组成为研究基因表达的主要手段,转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有rna的总和,主要包括 mrna和非编码rna 。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。 20210311
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